威斯康星大学麦迪逊分校生物医学工程系研究生阶段开设有以下学位项目，分别是：
生物医学工程硕士（MS）：要求申请者本科毕业，拥有工程（如生物医学工程、化学工程、电气工程、工业工程、机械工程等）专业背景，需要递交GRE成绩但未设定有最低分数要求。
生物医学工程博士（PhD）：要求申请者本科毕业，拥有工程（如生物医学工程、化学工程、电气工程、工业工程、机械工程等）专业背景，需要递交GRE成绩但未设定有最低分数要求。
9月开学，雅思7，托福92
| 课程名 | 英文名 | |
|---|---|---|
| 1 | 生物材料与组织工程 | Biomaterials & Tissue Engineering |
| 2 | 生物力学 | Biomechanics |
| 3 | 生物医疗图像与光学 | Biomedical Imaging & Optics |
| 4 | 细胞与分子工程 | Cellular & Molecular Engineering |
| 5 | 设备与元件 | Instrumentation & Devices |
| 6 | 神经工程 | Neuroengineering |
| 7 | 系统与复合生物学 | Systems & Synthetic Biology |
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